ＪＲ東日本千葉事業本部は２５日、運休が続く４路線の一部区間で２８日からバスによる代行輸送を検討していると発表した。ただ、道路の通行止めや渋滞の影響で、ルートの確保や運行本数などの調整が必要という。
２６日以降も運休が続くのは、総武線（榎戸―成東）、成田線（佐原―銚子）、内房線（姉ヶ崎―木更津）、久留里線（木更津―上総亀山）。線路への土砂流入や道床の流出、電力設備の損傷など被害が広範囲で、復旧に時間を要する。
久留里線の木更津―久留里駅間は１０月３日、成田線は１０月４日の再開を目指す。一方、被害が特に大きい総武線は１か月程度、内房線は少なくとも３か月程度、復旧に要する見込み。久留里線の久留里―上総亀山駅間は再開のめどが立っていない。
２６日以降の一部区間の運休で、約７万８０００人の通勤・通学客らに影響する。２８日から運休区間でバスの代行輸送を検討しているが、実施方法の調整に難航している。バスだけでは足りないため、テレワークの活用なども呼びかけている。